1、分子是由原子组成的，原子由原子核与核外电子组成，原子核由质子和中子组成，质子带正电荷，核外电子带负电荷，中子不带电，因为质子数=核外电子数，所以原子不带电。
2、分子是保持化学性质的最小微粒，在化学变化中，分子变为原子，原子再重新结合，原子是化学变化中最小微粒．故在化学变化中，分子可分，原子不可分。
3、分子与原子都是构成物质的一种粒子，质量和体积都非常小，彼此间有间隔，在不停地运动，都既有种类之分，又有个数之别，都不显电性。分子原子之间的联系：由分子（例如H2O）构成的物质，分子是保持物质化学性质的最小粒子。由原子(CU)构成的物质，原子是保持物质化学性质的最小粒子。同时分子又是原子构成的。
