如何比较两个蛋白的同源性

1、利用生物信息学方法，比较两个蛋白的编码基因的序列相似性，如blast可以根据其评分（e值）来预测两个蛋白的同源性

2、分析两个蛋白的核酸序列，也有相应的软件可以分析，如HMMTOP server等

3、分析蛋白的空间结构和拓扑结构

4、分析蛋白的转录时段

5、分析该蛋白在细胞中的定位，可以用一些融合蛋白，用tag等标记

6、可以看一下编码该蛋白的开放阅读框在染色体上的位置是否一致