1、加热杀菌法 对于大多数霉菌，加热至80℃，持续20分钟即可杀灭；但黄曲霉毒素耐高温，巴氏消毒（80℃）不能破坏其毒性。
2、射线杀菌法 霉菌抗射线能力较弱，可用放射性同位素放出的射线杀灭霉菌。
3、密封保藏防霉 霉菌多属于需氧微生物，生长繁殖需要氧气，所以瓶（罐）装食品在灭菌后，充以氮气或二氧化碳，加入脱氧剂、将食物夯实，进行脱气处理或加入油封等，都可以造成缺氧环境，防止大多数霉菌繁殖。
4、防霉剂防霉 市场上的高效防霉剂对霉菌有较强的抑制作用，并可抑制霉菌形成霉菌毒素，减少食品中毒、致病致癌的可能，用于瓶、罐装食品及霉菌容易增殖的、暴露于空气中的食品表面，抗霉效果十分显著。可广泛用于月饼、馅料、剁辣椒、肉制品、豆制品、糕点、面包、罐头、蜜饯、酱菜、酱油、食醋、米酒、果酒、水果、蔬菜、粮食、烟草、饲料的防霉抗腐。
