1、消化系统疾病及功能紊乱
口腔黏膜和胃肠黏膜都执行着消化功能，有慢性胃炎、胃溃疡、便秘、痔疮等胃肠道疾病的患者复发性口疮的发病率会明显增高，且其发作频率和严重程度常受胃肠疾患的影响。
2、内分泌变化
有些女性每逢经期前后就会出现口腔溃疡。可能与雌激素水平降低、孕酮水平增高有关，内分泌失调也会引起口腔溃疡。
3、遗传因素
复发性口疮一般具有遗传性，直系亲属若存在频发性的口腔溃疡，则下一辈患病几率较大，但发作频率和程度却不同。
4、精神心理因素
有的人在精神紧张、情绪波动、睡眠状况不佳等情况下也会患上口腔溃疡，这可能与植物神经功能失调有关。
5、缺乏元素
包括缺乏微量元素锌、铁、叶酸、维生素B12等，可能会降低免疫功能，从而增加复发性口腔溃疡发病的可能性。
