1、选择少病地块。在第1年瓜田里没有或极少有因枯萎病死苗的情况时，说明该地块枯萎病菌很少。这样的地第2年可以重茬种植西瓜，但应采取相应措施。
2、冬前深翻冻垡。将准备种重茬西瓜的地块于上年冬前深翻，并按行距挖好瓜沟，进行冻垡。开春后按要求施入基肥，回填瓜沟。这样既可冻死地下害虫，也可减少枯萎病的发生。
3、清园与错行播种相结合。第1年西瓜拉蔓后要及时清理瓜田，清除所有残枝落叶。连作的瓜行要与上茬瓜行错开播种，错开距离要达到60厘米。此外，不能将瓜蔓随便扔在田边地头的灌水沟内，否则，病菌会随灌水回到瓜田。
4、采用药剂预防。不建议使用杀菌药剂。因为使用杀菌剂后形成无菌环境，有害菌比有益菌更容易滋生，很难彻底解决西瓜重茬病问题。使用方法以灌根为主，配合叶面喷施。
5、不深压瓜蔓。为减少瓜田的病菌侵染机会，一般不采取暗压蔓的方法，而采取明压方法。
6、嫁接栽培。如果上茬西瓜病害较重，则应采取嫁接栽培措施，因为嫁接后可避免或减少枯萎病菌的侵染。
7、施用有机肥。能快速培肥土壤，补充有机质，并抑制土壤中多种土传病害病菌，减少西瓜发病率。
