1、蓝细菌与其他光合细菌最大的区别是，其他光合细菌在光合过程中不会放出氧气，而蓝细菌却能源源不断地往空中输送氧气。经过长期不断地释放氧气，终于改变了大气的组成，进而在高空形成臭氧层，挡住了紫外线，为以后的需氧生物提供了有利的生存环境，并为海洋生物登陆提供了条件。
2、蓝细菌还能把大气中的游离氮（N2）同氢（H）合成氨（NH3），这就是蓝藻所进行的固氮作用。这也解释了为什么防治水体富营养化是控制磷的排放，也诠释了用无磷洗衣粉的道理。
3、能进行固氮的蓝细菌大多分化为两种细胞：营养细胞和异形胞。在光合过程中，营养细胞能制糖和发电，而异形胞在特定条件下，能催化放出理想的燃料——氢来。
