1、第一阶段：全面修复
免疫因子到达病灶后开始快速修复衰老、损伤的上皮细胞，促进其产生新生细胞，从而疏通上皮细胞的组织脉络，使甲状腺滤泡的激素分泌功能得以恢复，使甲状腺在短期内恢复正常功能。
2、第二阶段：改善腺体环境
免疫因子有效抑制了甲状腺功能的病变，实现自我分化和更新代替，产生新的免疫细胞，从而改善了病变的甲状腺组织的微环境，改变病态大环境，调整全身微循环系统。
3、第三阶段：解决表征问题
腺体组织修复疗法有有效抑制了甲状腺功能的病变，使甲状腺自身的正常分泌和免疫功能得到恢复，在利用其改变了甲状腺组织循环系统，并提高巩固患者机体免疫力，并借助中药用于恢复身体正常代谢、脏器功能，同时消除症状。
4、第四阶段、提高免疫 疗效巩固
腺体组织修复疗法在治疗中期结合中医辨证巩固治疗，合理配制的药物吸收率高，可以迅速作用于病灶解除病症，通络活血，清热化毒。而且中医治疗不损伤患者肝、肾等脏器功能，不会产生不良反应，也避免了系列并发症。
