刺豚和河豚的区别主要在于形态特征不同、含毒部位不同、习性不同、分布地区不同等。
形态特征不同：刺豚的刺较为坚硬，腹部的含毒气囊会起到保护自己的作用；而河豚身体较短且肥厚，身体外缘的刺较为细小，遇到危险时它们的腹腔会迅速膨胀，从而使整个身体呈球形浮上水面，而与此同时身体上的小刺会竖起，用以自卫。
含毒部位不同：刺豚肝脏含有剧毒；而河豚的筋肉、皮、卵巢均有毒。
习性不同：刺豚会在春夏季向近海移动，然后在沿岸海域产卵；河豚则会进入淡水，常在江河中产卵。
分布地区不同：刺豚主要分布在热带近海区，在我国南海等近海海域均有分布；而河豚在我国分布十分广泛，沿海地区几乎全年均可捕获，约有四十余种。
