大小区别：原核细胞小；真核细胞大。
种类区别：原核细胞包括细菌、蓝藻、放线菌等；真核细胞包括动物、植物、真菌等。
细胞壁区别：原核生物为肽聚糖；真核为纤维素和果胶。
繁殖区别：原核生物只进行无性生殖；真核细胞进行有性生殖。
遗传规律区别：原核生物遗传不遵循孟德尔的遗传规律；真核生物遗传遵循孟德尔的遗传规律。
原核细胞概念
原核细胞是组成原核生物的细胞。这类细胞主要特征是没有以核膜为界的细胞核，也没有核仁，只有拟核，进化地位较低。原核细胞没有核膜，遗传物质集中在一个没有明确界限的低电子密度区。DNA为裸露的环状分子，通常没有结合蛋白，环的直径约为2.5纳米，周长约几十纳米。没有恒定的内膜系统，核糖体为70S型，原核细胞构成的生物称为原核生物，均为单细胞生物，通常称为细菌。
真核细胞概念
真核细胞指含有真核（被核膜包围的核）的细胞。其染色体数在一个以上，能进行有丝分裂。还能进行原生质流动和变形运动。而光合作用和氧化磷酸化作用则分别由叶绿体和线粒体进行。除细菌和蓝藻植物的细胞以外，所有的动物细胞以及植物细胞都属于真核细胞。
